Bien qu'iScriba ne gère pas spécifiquement les avances, il est tout à fait possible d'en faire apparaître sur une facture. Il suffit pour cela d'ajouter un paiement à la facture, en y reprenant le montant de l'avance. Ainsi, la facture affichera un total à payer dont le montant de l'avance sera déduit.